別にTSUBAKIがよくないのではなく、一般的にスーパーなどで売っている商品全てがよくないとその美容師は言いたいのだと思います(ただたまたま質問者様がTSUBAKIを使っていると言ったのでTSUBAKIを名指ししただけで)
当然自分のところで扱っているシャンプーを買わせたいためですが、実際市販されているシャンプーにはシリコンなどの成分(髪の指どおりをよくするために)や必要以上の香料などが入っているのでよくないといえばよくないです。
価格が高価なものはそれらの成分を天然のものに置きかえて作っていたり、界面活性剤を使わず石鹸成分を使っていたりなど色々工夫しているようなので確かに安心かもしれません。
ただ髪そのものにはよいのですがその分使い心地が良くなかったり、もちろん価格も高くなった上、気軽にどこででも買えない(美容院や通販で購入しなければならない)などの制約がつき結構面倒なことになってきます。
どこに優先順位をおくかは人それぞれですからこれらのことをふまえた上で選択されたらよいかと思います。