紳助さん数本のレギュラー番組やスポンサーを抱えており間違いなく契約の問題が浮上します。場合によっては違約金が発生します。紳助さんと吉本興業の雇用契約がどうなってるかは知りませんが普通被雇用者の問題は雇用主が落とし前を付けるモノであり、違約金は紳助さんではなく吉本が支払わなければなりません。
過去に、芸人のかなり不当な雇用状態をなんとかしようと組合を立ち上げようとした事があると紳助さんが仰っていたことがあります。
憶測に満ちた私見ですが、予てからわだかまりがある吉本に対する攻撃、あるいは抵抗。そんなものがあるのでは。